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Le méthane (CH4) provient principalement de la méthanogénèse (décomposition de la matière organique dans le secteur agricole). Certaines autres activités émettent également du CH4 en quantité importante : les décharges (également décomposition de la matière organique) et la distribution de gaz naturel par exemple (fuites aux jointures des canalisations, travaux...). Enfin, la combustion de biomasse ainsi que les tourbières, marais et eaux stagnantes sont des sources d'émission de méthane non négligeables.
Le secteur agricole (élevage) est le principal émetteur de CH4 en Alsace (environ 40 % des émissions totales). Avec 29% des émissions totales, le traitement des déchets représentent également une forte part d'émissions de méthane en région.
Les émissions présentent des variations annuelles liées aux décharges, au traitement de l'eau, à l'augmentation de la distribution de gaz naturel mais également à l'industrie chimique et aux transports routiers.
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